Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NHLH2Q02577 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms