Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP27A1Q02318 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP27A1Q02318 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP27A1Q02318 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms