Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF17Q02223 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNFRSF17Q02223 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms