Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms