Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRCDQ00LT1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms