Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK6Q00534 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK6Q00534 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.3 ms