Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTHL1P78549 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTHL1P78549 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 985.6 ms