Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP1P78357 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP1P78357 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP1P78357 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms