Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX1P78337 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITX1P78337 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITX1P78337 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITX1P78337 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITX1P78337 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITX1P78337 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITX1P78337 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITX1P78337 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITX1P78337 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX1P78337 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITX1P78337 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITX1P78337 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITX1P78337 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITX1P78337 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITX1P78337 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX1P78337 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX1P78337 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX1P78337 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX1P78337 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX1P78337 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX1P78337 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX1P78337 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX1P78337 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX1P78337 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PITX1P78337 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PITX1P78337 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PITX1P78337 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITX1P78337 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX1P78337 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX1P78337 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX1P78337 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX1P78337 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX1P78337 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX1P78337 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX1P78337 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX1P78337 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX1P78337 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX1P78337 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITX1P78337 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITX1P78337 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITX1P78337 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PITX1P78337 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PITX1P78337 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITX1P78337 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PITX1P78337 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms