Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HBG1P69891 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HBG1P69891 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBG1P69891 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBG1P69891 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBG1P69891 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBG1P69891 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBG1P69891 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HBG1P69891 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HBG1P69891 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBG1P69891 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBG1P69891 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBG1P69891 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBG1P69891 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBG1P69891 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBG1P69891 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBG1P69891 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HBG1P69891 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HBG1P69891 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms