Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOMO3P69849 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOMO3P69849 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOMO3P69849 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms