Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SUMO1P63165 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms