Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMC6P62333 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSMC6P62333 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMC6P62333 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms