Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AP1S1P61966 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S1P61966 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms