Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VBP1P61758 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VBP1P61758 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
VBP1P61758 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
VBP1P61758 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VBP1P61758 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VBP1P61758 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VBP1P61758 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VBP1P61758 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VBP1P61758 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VBP1P61758 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VBP1P61758 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VBP1P61758 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VBP1P61758 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VBP1P61758 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VBP1P61758 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VBP1P61758 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VBP1P61758 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VBP1P61758 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VBP1P61758 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VBP1P61758 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VBP1P61758 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VBP1P61758 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VBP1P61758 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VBP1P61758 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VBP1P61758 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VBP1P61758 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VBP1P61758 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
VBP1P61758 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VBP1P61758 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VBP1P61758 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VBP1P61758 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VBP1P61758 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VBP1P61758 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VBP1P61758 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VBP1P61758 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VBP1P61758 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VBP1P61758 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VBP1P61758 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VBP1P61758 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VBP1P61758 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VBP1P61758 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VBP1P61758 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VBP1P61758 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms