Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3P61158 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACTR3P61158 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.6 ms