Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2BFSP57053 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms