Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM50BP56557 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM50BP56557 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM50BP56557 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms