Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFERP55789 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFERP55789 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFERP55789 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFERP55789 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFERP55789 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFERP55789 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFERP55789 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GFERP55789 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFERP55789 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFERP55789 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFERP55789 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFERP55789 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFERP55789 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFERP55789 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFERP55789 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFERP55789 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFERP55789 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFERP55789 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFERP55789 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFERP55789 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFERP55789 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFERP55789 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFERP55789 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFERP55789 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFERP55789 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFERP55789 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFERP55789 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFERP55789 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFERP55789 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFERP55789 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFERP55789 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFERP55789 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFERP55789 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFERP55789 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GFERP55789 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFERP55789 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFERP55789 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFERP55789 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFERP55789 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFERP55789 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFERP55789 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFERP55789 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFERP55789 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFERP55789 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFERP55789 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFERP55789 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFERP55789 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFERP55789 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFERP55789 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFERP55789 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms