Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP9P55211 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP9P55211 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP9P55211 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP9P55211 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP9P55211 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP9P55211 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP9P55211 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP9P55211 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP9P55211 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP9P55211 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP9P55211 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP9P55211 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP9P55211 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP9P55211 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP9P55211 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP9P55211 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP9P55211 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP9P55211 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP9P55211 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP9P55211 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP9P55211 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP9P55211 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP9P55211 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP9P55211 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP9P55211 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP9P55211 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP9P55211 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP9P55211 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP9P55211 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP9P55211 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP9P55211 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP9P55211 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP9P55211 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP9P55211 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP9P55211 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP9P55211 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP9P55211 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP9P55211 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP9P55211 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP9P55211 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP9P55211 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP9P55211 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP9P55211 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP9P55211 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP9P55211 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP9P55211 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP9P55211 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP9P55211 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP9P55211 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP9P55211 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP9P55211 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP9P55211 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP9P55211 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP9P55211 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms