Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF10P55107 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF10P55107 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF10P55107 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF10P55107 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF10P55107 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF10P55107 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDF10P55107 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDF10P55107 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDF10P55107 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF10P55107 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF10P55107 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF10P55107 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF10P55107 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF10P55107 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF10P55107 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF10P55107 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF10P55107 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF10P55107 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF10P55107 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF10P55107 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF10P55107 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF10P55107 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF10P55107 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF10P55107 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF10P55107 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF10P55107 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF10P55107 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF10P55107 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF10P55107 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF10P55107 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF10P55107 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF10P55107 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF10P55107 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF10P55107 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF10P55107 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF10P55107 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF10P55107 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF10P55107 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF10P55107 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF10P55107 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF10P55107 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF10P55107 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF10P55107 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF10P55107 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF10P55107 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF10P55107 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF10P55107 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF10P55107 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF10P55107 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms