Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP1P54107 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CRISP1P54107 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms