Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2JP52435 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms