Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAP1GDS1P52306 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAP1GDS1P52306 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAP1GDS1P52306 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAP1GDS1P52306 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAP1GDS1P52306 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAP1GDS1P52306 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms