Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEK4P51957 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NEK4P51957 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEK4P51957 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEK4P51957 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NEK4P51957 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEK4P51957 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEK4P51957 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK4P51957 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK4P51957 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK4P51957 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK4P51957 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK4P51957 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK4P51957 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK4P51957 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK4P51957 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK4P51957 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK4P51957 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK4P51957 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK4P51957 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK4P51957 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK4P51957 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK4P51957 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK4P51957 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEK4P51957 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEK4P51957 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEK4P51957 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEK4P51957 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK4P51957 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK4P51957 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK4P51957 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK4P51957 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK4P51957 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK4P51957 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK4P51957 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK4P51957 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEK4P51957 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEK4P51957 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK4P51957 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK4P51957 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK4P51957 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK4P51957 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK4P51957 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK4P51957 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK4P51957 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK4P51957 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK4P51957 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK4P51957 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK4P51957 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK4P51957 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK4P51957 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK4P51957 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK4P51957 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK4P51957 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK4P51957 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK4P51957 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK4P51957 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK4P51957 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEK4P51957 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEK4P51957 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEK4P51957 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEK4P51957 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms