Protein–RNA interactions for Protein: P51826

AFF3, AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3P51826 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFF3P51826 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFF3P51826 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFF3P51826 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFF3P51826 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFF3P51826 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF3P51826 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF3P51826 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF3P51826 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF3P51826 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF3P51826 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF3P51826 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFF3P51826 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFF3P51826 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFF3P51826 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFF3P51826 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFF3P51826 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFF3P51826 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF3P51826 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF3P51826 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF3P51826 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF3P51826 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF3P51826 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF3P51826 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFF3P51826 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF3P51826 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF3P51826 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF3P51826 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF3P51826 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF3P51826 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF3P51826 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFF3P51826 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF3P51826 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF3P51826 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF3P51826 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF3P51826 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF3P51826 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF3P51826 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF3P51826 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFF3P51826 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF3P51826 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFF3P51826 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms