Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR8P51685 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR8P51685 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR8P51685 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCR8P51685 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR8P51685 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR8P51685 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR8P51685 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR8P51685 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR8P51685 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR8P51685 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR8P51685 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR8P51685 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR8P51685 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR8P51685 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR8P51685 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR8P51685 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR8P51685 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR8P51685 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR8P51685 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR8P51685 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR8P51685 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR8P51685 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR8P51685 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR8P51685 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR8P51685 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR8P51685 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR8P51685 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR8P51685 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR8P51685 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR8P51685 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR8P51685 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR8P51685 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms