Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF10P50591 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFSF10P50591 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFSF10P50591 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF10P50591 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms