Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX5P50542 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX5P50542 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX5P50542 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX5P50542 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX5P50542 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX5P50542 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX5P50542 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX5P50542 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX5P50542 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX5P50542 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX5P50542 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX5P50542 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX5P50542 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX5P50542 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX5P50542 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX5P50542 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX5P50542 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX5P50542 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX5P50542 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX5P50542 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX5P50542 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX5P50542 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX5P50542 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX5P50542 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX5P50542 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX5P50542 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX5P50542 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX5P50542 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX5P50542 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX5P50542 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX5P50542 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX5P50542 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX5P50542 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX5P50542 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX5P50542 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX5P50542 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX5P50542 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX5P50542 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX5P50542 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX5P50542 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX5P50542 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX5P50542 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX5P50542 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX5P50542 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX5P50542 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX5P50542 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX5P50542 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX5P50542 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX5P50542 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX5P50542 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX5P50542 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms