Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GATMP50440 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GATMP50440 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GATMP50440 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GATMP50440 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GATMP50440 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATMP50440 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATMP50440 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATMP50440 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATMP50440 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATMP50440 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATMP50440 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATMP50440 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATMP50440 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GATMP50440 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATMP50440 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GATMP50440 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GATMP50440 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GATMP50440 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GATMP50440 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATMP50440 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GATMP50440 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATMP50440 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATMP50440 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATMP50440 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATMP50440 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATMP50440 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATMP50440 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATMP50440 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATMP50440 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATMP50440 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATMP50440 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATMP50440 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATMP50440 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATMP50440 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATMP50440 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATMP50440 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATMP50440 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATMP50440 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATMP50440 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATMP50440 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATMP50440 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATMP50440 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATMP50440 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATMP50440 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GATMP50440 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATMP50440 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATMP50440 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATMP50440 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATMP50440 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATMP50440 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATMP50440 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATMP50440 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATMP50440 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATMP50440 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATMP50440 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GATMP50440 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms