Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIG4P49917 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIG4P49917 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG4P49917 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG4P49917 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG4P49917 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG4P49917 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG4P49917 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIG4P49917 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIG4P49917 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIG4P49917 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LIG4P49917 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIG4P49917 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIG4P49917 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIG4P49917 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIG4P49917 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIG4P49917 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIG4P49917 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIG4P49917 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIG4P49917 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIG4P49917 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIG4P49917 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIG4P49917 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LIG4P49917 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIG4P49917 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIG4P49917 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIG4P49917 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIG4P49917 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIG4P49917 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIG4P49917 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIG4P49917 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIG4P49917 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIG4P49917 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIG4P49917 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIG4P49917 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIG4P49917 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIG4P49917 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LIG4P49917 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LIG4P49917 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LIG4P49917 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.7 ms