Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSK3BP49841 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSK3BP49841 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms