Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLK1P49759 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLK1P49759 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLK1P49759 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK1P49759 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK1P49759 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK1P49759 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK1P49759 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK1P49759 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK1P49759 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLK1P49759 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK1P49759 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK1P49759 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK1P49759 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms