Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP4P49662 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP4P49662 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP4P49662 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP4P49662 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP4P49662 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP4P49662 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP4P49662 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP4P49662 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP4P49662 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP4P49662 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP4P49662 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP4P49662 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP4P49662 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP4P49662 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP4P49662 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP4P49662 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP4P49662 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP4P49662 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP4P49662 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP4P49662 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP4P49662 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP4P49662 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP4P49662 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP4P49662 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP4P49662 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP4P49662 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP4P49662 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP4P49662 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP4P49662 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP4P49662 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP4P49662 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP4P49662 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP4P49662 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP4P49662 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP4P49662 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP4P49662 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP4P49662 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP4P49662 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP4P49662 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP4P49662 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP4P49662 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP4P49662 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP4P49662 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP4P49662 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP4P49662 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP4P49662 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP4P49662 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP4P49662 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP4P49662 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP4P49662 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP4P49662 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP4P49662 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP4P49662 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP4P49662 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP4P49662 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP4P49662 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP4P49662 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP4P49662 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP4P49662 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP4P49662 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP4P49662 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP4P49662 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP4P49662 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP4P49662 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP4P49662 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms