Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU3F4P49335 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POU3F4P49335 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms