Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPINT3P49223 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINT3P49223 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms