Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRIP1P48552 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms