Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXRGP48443 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXRGP48443 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXRGP48443 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXRGP48443 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXRGP48443 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXRGP48443 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXRGP48443 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXRGP48443 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXRGP48443 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXRGP48443 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXRGP48443 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXRGP48443 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXRGP48443 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RXRGP48443 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXRGP48443 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RXRGP48443 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RXRGP48443 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RXRGP48443 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RXRGP48443 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RXRGP48443 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RXRGP48443 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RXRGP48443 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RXRGP48443 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RXRGP48443 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RXRGP48443 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRGP48443 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRGP48443 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRGP48443 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRGP48443 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RXRGP48443 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RXRGP48443 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRGP48443 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRGP48443 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRGP48443 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRGP48443 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRGP48443 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRGP48443 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RXRGP48443 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRGP48443 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRGP48443 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRGP48443 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRGP48443 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RXRGP48443 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RXRGP48443 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRGP48443 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRGP48443 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRGP48443 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRGP48443 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRGP48443 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRGP48443 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms