Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME1P48163 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME1P48163 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME1P48163 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME1P48163 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME1P48163 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME1P48163 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ME1P48163 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME1P48163 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME1P48163 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME1P48163 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME1P48163 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME1P48163 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ME1P48163 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ME1P48163 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME1P48163 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME1P48163 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME1P48163 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME1P48163 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME1P48163 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME1P48163 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME1P48163 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME1P48163 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME1P48163 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ME1P48163 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME1P48163 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME1P48163 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME1P48163 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME1P48163 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME1P48163 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ME1P48163 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ME1P48163 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME1P48163 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME1P48163 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ME1P48163 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME1P48163 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME1P48163 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME1P48163 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ME1P48163 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ME1P48163 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME1P48163 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ME1P48163 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME1P48163 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME1P48163 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME1P48163 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME1P48163 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME1P48163 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME1P48163 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME1P48163 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ME1P48163 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME1P48163 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME1P48163 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME1P48163 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ME1P48163 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME1P48163 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME1P48163 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME1P48163 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME1P48163 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME1P48163 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME1P48163 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME1P48163 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME1P48163 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME1P48163 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME1P48163 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME1P48163 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME1P48163 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME1P48163 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME1P48163 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME1P48163 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME1P48163 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME1P48163 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME1P48163 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ME1P48163 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ME1P48163 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME1P48163 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME1P48163 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME1P48163 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME1P48163 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms