Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCAMP43121 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCAMP43121 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCAMP43121 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCAMP43121 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCAMP43121 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCAMP43121 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCAMP43121 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCAMP43121 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MCAMP43121 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MCAMP43121 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCAMP43121 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MCAMP43121 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCAMP43121 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCAMP43121 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCAMP43121 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCAMP43121 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCAMP43121 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCAMP43121 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCAMP43121 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCAMP43121 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCAMP43121 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MCAMP43121 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MCAMP43121 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCAMP43121 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCAMP43121 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCAMP43121 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCAMP43121 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MCAMP43121 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCAMP43121 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCAMP43121 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCAMP43121 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCAMP43121 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCAMP43121 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCAMP43121 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCAMP43121 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCAMP43121 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MCAMP43121 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCAMP43121 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCAMP43121 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MCAMP43121 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCAMP43121 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCAMP43121 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCAMP43121 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCAMP43121 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MCAMP43121 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCAMP43121 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCAMP43121 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCAMP43121 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms