Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGIRP43119 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGIRP43119 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms