Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTGER2P43116 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTGER2P43116 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTGER2P43116 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTGER2P43116 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTGER2P43116 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTGER2P43116 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGER2P43116 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTGER2P43116 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms