Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A1P43005 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms