Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL35P42766 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL35P42766 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL35P42766 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL35P42766 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL35P42766 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL35P42766 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPL35P42766 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL35P42766 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL35P42766 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL35P42766 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL35P42766 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL35P42766 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL35P42766 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL35P42766 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL35P42766 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL35P42766 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL35P42766 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL35P42766 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL35P42766 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL35P42766 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL35P42766 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL35P42766 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL35P42766 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL35P42766 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms