Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIA1P42261 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA1P42261 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms