Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FLT4P35916 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FLT4P35916 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FLT4P35916 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
FLT4P35916 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FLT4P35916 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FLT4P35916 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FLT4P35916 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
FLT4P35916 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
FLT4P35916 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FLT4P35916 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FLT4P35916 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FLT4P35916 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FLT4P35916 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FLT4P35916 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FLT4P35916 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT4P35916 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT4P35916 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT4P35916 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT4P35916 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT4P35916 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT4P35916 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT4P35916 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FLT4P35916 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FLT4P35916 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FLT4P35916 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FLT4P35916 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FLT4P35916 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FLT4P35916 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FLT4P35916 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FLT4P35916 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FLT4P35916 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FLT4P35916 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FLT4P35916 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FLT4P35916 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FLT4P35916 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FLT4P35916 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FLT4P35916 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FLT4P35916 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FLT4P35916 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FLT4P35916 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FLT4P35916 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
FLT4P35916 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FLT4P35916 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FLT4P35916 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FLT4P35916 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FLT4P35916 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FLT4P35916 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FLT4P35916 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FLT4P35916 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FLT4P35916 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FLT4P35916 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FLT4P35916 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FLT4P35916 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FLT4P35916 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FLT4P35916 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FLT4P35916 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FLT4P35916 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FLT4P35916 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FLT4P35916 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FLT4P35916 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FLT4P35916 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT4P35916 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT4P35916 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT4P35916 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT4P35916 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT4P35916 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT4P35916 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FLT4P35916 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FLT4P35916 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FLT4P35916 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
FLT4P35916 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT4P35916 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT4P35916 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT4P35916 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FLT4P35916 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FLT4P35916 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms