Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMP3P35625 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms