Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM4P33991 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM4P33991 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM4P33991 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM4P33991 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM4P33991 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM4P33991 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM4P33991 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM4P33991 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM4P33991 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM4P33991 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM4P33991 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM4P33991 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM4P33991 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM4P33991 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM4P33991 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM4P33991 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM4P33991 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM4P33991 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM4P33991 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM4P33991 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM4P33991 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM4P33991 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM4P33991 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM4P33991 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM4P33991 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM4P33991 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM4P33991 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM4P33991 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM4P33991 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM4P33991 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM4P33991 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM4P33991 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM4P33991 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM4P33991 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM4P33991 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM4P33991 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM4P33991 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM4P33991 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM4P33991 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM4P33991 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM4P33991 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM4P33991 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM4P33991 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM4P33991 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM4P33991 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM4P33991 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM4P33991 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM4P33991 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM4P33991 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM4P33991 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM4P33991 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM4P33991 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM4P33991 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM4P33991 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM4P33991 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM4P33991 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM4P33991 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM4P33991 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM4P33991 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM4P33991 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms