Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDELR2P33947 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms