Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	BCY1	YIL033C	1251 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SUP2	tY(GUA)D	75 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SUP11	tY(GUA)F1	75 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SUP6	tY(GUA)F2	75 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SUP7	tY(GUA)J1	75 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SUP4	tY(GUA)J2	75 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SUP5	tY(GUA)M1	75 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SUP8	tY(GUA)M2	75 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SUP3	tY(GUA)O	75 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	NRM1	YNR009W	750 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	FRE3	YOR381W	2136 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	PDC1	YLR044C	1692 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	TGL1	YKL140W	1647 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	ZWF1	YNL241C	1518 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	KCH1	YJR054W	1494 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	KKQ8	YKL168C	2175 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	MLF3	YNL074C	1359 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	OCA5	YHL029C	2040 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	MCM3	YEL032W	2916 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YCR099C	YCR099C	468 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SIP2	YGL208W	1248 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	WSS1	YHR134W	810 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	MDY2	YOL111C	639 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	CKA2	YOR061W	1020 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	ARN2	YHL047C	1863 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	MTF2	YDL044C	1323 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	MRT4	YKL009W	711 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	PRM9	YAR031W	897 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SPO20	YMR017W	1194 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	CAM1	YPL048W	1248 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	FRS2	YFL022C	1512 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YEH1	YLL012W	1722 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	SMF2	YHR050W	1650 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	NHA1	YLR138W	2958 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	RPT2	YDL007W	1314 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	GPD2	YOL059W	1323 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	RPS16B	YDL083C	432 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YDL157C	YDL157C	357 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	RSM10	YDR041W	612 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	MRPL35	YDR322W	1104 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	LCL3	YGL085W	825 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YJU3	YKL094W	942 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YKR104W	YKR104W	921 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	BUD14	YAR014C	2130 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YLR198C	YLR198C	360 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	PSY3	YLR376C	729 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	MTG1	YMR097C	1104 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	CTL1	YMR180C	963 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	TAF9	YMR236W	474 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	MRPS18	YNL306W	654 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	RRS1	YOR294W	612 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	CSG2	YBR036C	1233 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	WHI2	YOR043W	1461 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	EXO1	YOR033C	2109 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	CUS1	YMR240C	1311 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	FSH1	YHR049W	732 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	YNR040W	YNR040W	771 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SIP1	P32578	IDP1	YDL066W	1287 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YDR445C	YDR445C	408 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	TCA17	YEL048C	459 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	Q0144	Q0144	330 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	tR(ACG)D	tR(ACG)D	73 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	tR(ACG)E	tR(ACG)E	73 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	tR(ACG)K	tR(ACG)K	73 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	tR(ACG)L	tR(ACG)L	73 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	tR(ACG)O	tR(ACG)O	73 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YLL047W	YLL047W	384 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	UBC12	YLR306W	567 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	CDA2	YLR308W	939 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	FPR3	YML074C	1236 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	RHO2	YNL090W	579 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	snR3	snR3	194 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	RAD3	YER171W	2337 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	AFT1	YGL071W	2073 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	IBA57	YJR122W	1494 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	NTH2	YBR001C	2343 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YIL067C	YIL067C	2037 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	HSP78	YDR258C	2436 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	PCL2	YDL127W	927 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	UGX2	YDL169C	672 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	RPT6	YGL048C	1218 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	CIA2	YHR122W	696 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YKL153W	YKL153W	510 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YKR047W	YKR047W	306 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	PAU17	YLL025W	375 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	HRT3	YLR097C	1035 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	RSF1	YMR030W	1131 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YMR178W	YMR178W	825 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	DIA1	YMR316W	1011 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	PGA2	YNL149C	390 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	VPS68	YOL129W	555 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	ACS2	YLR153C	2052 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YNL095C	YNL095C	1929 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	UBP9	YER098W	2265 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	ACC1	YNR016C	6702 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	GAS2	YLR343W	1668 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	snR63	snR63	255 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YDL057W	YDL057W	987 nt		5	□□□□□ -1.61

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